DNA में मौजूद फॉस्फेट समूह आयनिक और आवेशित होते हैं। DNA के प्रत्येक फॉस्फेट समूह में ऋणात्मक आवेश (-1) होता है। आवेशित अणु जल को आकर्षित करते हैं और जल-अनुकूल होते हैं। DNA में दो बाहरी जल-अनुकूल ध्रुवीय रीढ़ होती हैं, जो शर्करा और फॉस्फेट समूहों से बनी होती हैं और एस्टर बॉन्ड द्वारा जुड़ी होती हैं। इसलिए, न्यूक्लिक एसिड के रूप में DNA की पहचान फॉस्फोडाइएस्टर बॉन्ड की उपस्थिति से होती है।
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