शैवाल को तीन मुख्य श्रेणियों में वर्गीकृत किया जाता है – क्लोरोफाइसी (हरित शैवाल), फियोफाइसी (भूरे शैवाल) और रोडोफाइसी (लाल शैवाल)। इन वर्गों का आधार प्रमुख प्रकाश संश्लेषी रंगद्रव्य, संचित भोजन का प्रकार, कोशिका भित्ति की संरचना और फ्लैजेला की संख्या व उनकी स्थिति होती है।
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